Хотя исследования предполагают мутуалистические отношения между кишечной флорой и человеком<ref>Sears, Синтия Л. (2005). "Динамичное партнерство: Празднование наших флору кишечника". анаэробные 11 (5):. 247-51 DOI : 10.1016 / j.anaerobe.2005.05.001 . PMID 16701579 .</ref>, однако нет достаточного количества исследований подтверждающих положительный симбиоз и благоприятное влияние пробиотических пищевых добавок на здоровье человека.<ref>Slashinski МДж, McCurdy SA, Achenbaum LS, Уитни С.Н., McGuire AL (2012). " " Змея-нефть "," знахарство "и" промышленно культивируемых организмов: "biovalue и коммерциализация Микрофлора человека исследований" . BMC Медицинская этика 13 :. 28 DOI : 10,1186 / 1472-6939-13-28 . PMC 3512494 . PMID 23110633 .</ref> Есть мнение, что улучшения кишечной флоры могут быть связаны скорее с долгосрочными диетическими изменениями в питании человека.<ref>Ву, GD; Чен, J;. Hoffmann, C;. Bittinger, K;. Чэнь, Ю.-Y;. Keilbaugh, SA; Bewtra, M;. Рыцари, D;. Уолтерс, WA; Рыцарь, R.; Синха, R;. Гилрой, E;. Гупта, K;. Baldassano, R;. Nessel, L;. Ли, Н;. Бушменов, FD; . Льюис, Джонни Депп (2011) "Связывание долгосрочные модели Диетические с Gut микробной Enterotypes" . Наука 334 (6052):. 105-8 DOI : 10.1126 / science.1208344 . PMC 3368382 . PMID 21885731 .</ref>

<blockquote>''«Пробиотики имеют клинический эффект в лечении диареи, но заявленное широкое применение преувеличено, поскольку организм человека сложная экосистема.»''</blockquote>