Тестостерон может превращаться в организме в [[эстрогены|эстроген]] (процесс, известный как ароматизация), а также в [[Дигидротестостерон]] (за счет работы фермента 5-альфа-редуктазы). Эстроген является причиной многих побочных эффектов, таких как [[гинекомастия]], задержка воды, и т.д. В то время дигидротестостерон иногда вызывает выпадение волос на голове и , увеличение простаты и др.

Частой Частая жалоба атлетов - болезненность в месте инъекции. Возможно развитие абсцесса.