Наиболее подходящее время для приема BCAA: утром, с середины тренировки и сразу после тренинга. Можно готовить перед тренировкой [[Спортивные энергетики в домашних условиях|энергетический напиток]], растворяя порцию аминокислот и несколько ложек сахара в воде. Это обеспечит постоянное поступление жидкости, углеводов и аминокислот в кровь во время всей тренировки. Как уже было сказано выше, организм особенно нуждается в BCAA во время и по окончании тренировки, именно тогда BCAA проявляют наибольшую эффективность, поэтому принимать их нужно В в середине и сразу после тренировки. Также желательно принимать порцию аминокислот сразу после сна для подавления утреннего [[Анаболизм и катаболизм|катаболизма]]. Исследования показали, что ВСАА эффективны даже при смешивании с протеиновым коктейлем.

Есть мнение, что нет смысла приема BCAA, как и других аминокислот и белков, перед тренировкой, поскольку во время нагрузки организм снижает функцию пищеварения, поэтому все белки и аминокислоты будут усвоены лишь по окончании тренировки,нагружая при этом пищеварение и отвлекая организм от работы. При этом получаем нарушение пищеварения и дополнительную нагрузку на почки,которые в процессе дезаминирования белков и аминокислот испытывают излишнюю нагрузку,превращая белки в энергию. Именно поэтому только марафонцы употребляют растворы аминокислот и [[изотоники]] прямо во время бега. Это другая нагрузка и и усвоение воды и растворов в ней не затаит женойзаторможено.Но белки и аминокислоты до забегов марафонцы не употребляют.Для этого больше подходят углеводы.

BCAA должны приниматься так же как описано выше: утром натощак, перед тренингом в середине тренинга и сразу после тренинга, растворимые формы - во время тренировки. Кроме того, при похудении, можно принимать BCAA в перерывах между едой, с целью подавления катаболизма, аппетита и сохранения мышц, однако выгоднее для этих целей использовать [[протеин]].