* В клинических испытаниях [http://www.uwa.edu.au/ Университета Западной Австралии], которые проводились с целью определения эффективности пробиотиков в сокращении риска возникновения аллергии у детей, выяснилось, что дети которым были прописаны пробиотики были более чувствительны к различным аллергенам.<ref>Bee, Peta (November 10, 2008). "Probiotics, Not so friendly after all". The Times (London).</ref>

* В 2007 году была опубликована работа о влиянии пробиотиков на кур, в которой исследователи заявили, что ожирение птицы связано с применением Lactobacillus fermentum или Lactobacillus SPP в их корме.<ref>Khan M, Raoult D, Richeta H, Lepidia H, La Scola B (2007). "Growth-promoting effects of single-dose intragastrically administered probiotics in chickens". British Poultry Science 48 (6): 732–735. doi:10.1080/00071660701716222. PMID 18085457.</ref> Именно это исследование положило начало мифу о том, что йогурты могут вызывать ожирение.<ref>Raoult D (September 2009). "Probiotics and obesity : a link ?". Nature Reviews Microbiology 7 (9): 616. doi:10.1038/nrmicro2209. PMID 21548178.</ref> Тем не менее, в настоящий момент не существует статистически достоверных фактов подтверждающих это мнение.<ref>Raoult, Didier (2009). "No link between probiotics and obesity? Author reply". Nature Reviews Microbiology 7 (12): 901. doi:10.1038/nrmicro2209-c3.</ref><ref>Ehrlich SD (2009). "Probiotics - little evidence for a link to obesity". Nature Reviews Microbiology 7 (12): 901; author reply 901. doi:10.1038/nrmicro2209-c1. PMID 19915581.</ref>