Фармацевтически (в одном шприце) несовместим с растворами [[Витамин В1|витаминов B1]] и [[Витамин В6|B6]] (ион кобальта способствует разрушению других витаминов). Усиливает вероятность аллергических реакций, вызываемых витамином B1. <ref>Цианокобаламин (Cyanocobalamin): инструкция, применение и формула http://www.rlsnet.ru/mnn_index_id_1411.htm</ref> Однако такие препараты как "Комбилипен" стабилизированы Гексацианоферрат(II) калия и поэтому совместимы в одном флаконе. <ref>Фармацевтическое обоснование комбинации действующих и вспомогательных веществ в составе препарата Мильгамма. http://www.mif-ua.com/archive/article/41272</ref> Также препараты витамина B12 несовместимы с [[Аскорбиновая кислота|аскорбиновой кислотой]], солями тяжелых металлов (инактивация цианокобаламина), [[рибофлавин]]ом. [[Аминогликозиды]], салицилаты, [[Противосудорожные препараты|противоэпилептические ЛС]], колхицин, препараты K+ снижают абсорбцию.<ref>Цианокобаламин. Описание препарата http://www.webapteka.ru/drugbase/name7469.html</ref>