На протяжении 1990-х гг. большинство клиник при трансплантации использовали различные иммунодепрессанты в сочетании с индукционной иммуносупрессивной терапией антилимфоцитарными препаратами моноклональных или поликлональных антител. Для поддерживающей иммуносупрессивной терапии применяют ингибиторы кальциневрина (циклоспорин или такролимус), глюкокортикоиды и антиметаболиты (азатиоприн или микофеноловую кислоту). Микофеноловая кислота заменила азатиоприн в стандартных схемах лечения после трансплантации. В настоящее время ряд клиник проводят исследования новых комбинаций препаратов, включающих циклоспорин или такролимус в сочетании с глюкокортикоидами и микофеноловой кислотой, иногда в комбинации с индукционной иммуносупрессивной терапией препаратами антител. Ряд новых препаратов более эффективно предотвращает отторжение и делает трансплантацию почки, печени, поджелудочной железы или сердца более доступной. Эффективность новых комбинаций препаратов возрождает идею отмены глюкокортикоидов. Современная иммуносупрессивная терапия направлена на предотвращение отторжения, снижение повреждающего действия на трансплантат и других побочных эффектов. Разработка иммунодепрессантов продолжается, но главная цель трансплантологии — достижение иммунологической толерантности. Для успешной борьбы с отторжением трансплантата и с аутоиммунными заболеваниями необходимо создать такие препараты и схемы лечения, чтобы «обмануть» иммунную систему и вынудить ее принять чужое за свое или «переучить» клетки, повреждающие собственные ткани. Другое направление — разработка вакцин, которые оказались бы эффективными не только при многочисленных инфекциях (таких, как туберкулез и ВИЧ-инфекция), но и при злокачественных новообразованиях и аутоиммунных заболеваниях. Новые подходы в иммунотерапии не только направлены на повышение эффективности и снижение токсичности препаратов, но и будут иметь важные экономические последствия и отразятся на полноценности жизни.