С момента открытия (1907 г.) пробиотиков И. Мечниковым, данная тема активно изучается различными институтами, поскольку полученные . Полученные к настоящему времени знания дают перспективу на основания полагать, что дальнейшее изучение свойств бактерий с целью улучшения перспективно в улучшении здоровья и благосостояния человека. Для того чтобы защитить потребителя необходима достаточно обширная научная база. В целом научная составляющая пробиотических эффектов требует определения здоровой микрофлоры, взаимодействие микрофлоры с хозяином, а также способность охарактеризовать эффективность пробиотика в здоровом и патологическом состоянии. Последние разработки с применением высокой пропускной способностью в секвенировании и как следствие развития метагеномики, представляют собой новый подход в изучении пробиотиков.<ref>Gueimonde М, Collado MC (2012). "Метагеномика и пробиотики». Клиническая микробиология и инфекции . 18 Дополнение 4: 32-4. DOI : 10.1111 / j.1469-0691.2012.03873.x . PMID 22647045 .</ref>

Исследовано и изучено влияние пробиотиков на механизм воспаление механизмы воспаления кишечника<ref>"Клиническая полезность пробиотиков против хронических воспалительных заболеваний кишечника". Журнал физиологии и фармакологии . 57 Дополнение 9 :. 23-33 PMID 17242485 .</ref>, на диарею<ref>Ян F, Polk DB (ноябрь 2006 года). "Пробиотики как функциональное питание в лечении диареи". Current Opinion в Clinical Nutrition и метаболических помощи 9 (6): 717-21. DOI : 10,1097 / 01.mco.0000247477.02650.51 . PMID 17053425 .</ref>, урогенитальные инфекции<ref>Рейд G (сентябрь 2008 г.). "Пробиотик Лактобактерии для мочеполовой здоровья женщин". J. Clin. Gastroenterol. 42 (Дополнение 3 Pt 2) :. S234-6 DOI : 10,1097 / MCG.0b013e31817f1298 . PMID 18685506 .</ref>, аллергию.<ref>Vanderhoof JA (ноябрь 2008). "Пробиотики в управлении аллергии". Журнал детской гастроэнтерологии и питания . 47 Дополнение 2: S38-40. DOI : 10,1097 / 01.mpg.0000338810.74933.c1 . PMID 18931598 .</ref> Однако научные данные остаются непризнанными [http://www.efsa.europa.eu/ Европейским ведомством по безопасности пищевых продуктов], поскольку причинно-следственная связь между потреблением пробиотиков и пользой для здоровья человека все еще не выяснена.<ref>Rijkers GT, де Вос WM, Бруммер RJ, Морелли L, Corthier G, Марто P (2011). "Польза для здоровья и пользе для здоровья пробиотиков: преодоление науки и маркетинг» . Британский журнал питания 106 (9): 1291-6. DOI : 10,1017 / S000711451100287X . PMID 21861940 .</ref><ref>"Научное мнение по обоснованию претензий здоровья, связанные с сочетанием Bifidobacterium Лонгум Лос-Анджелесе 101, Lactobacillus Helveticus Лос-Анджелесе 102, Lactococcus Lactis Лос-Анджелесе 103 и Streptococcus thermophillus Лос-Анджелесе 104 и снижения кишечный дискомфорт в соответствии со статьей 13 (5) Регламента (ЕС) № 1924/2006 (например, поиск EFSA для других отчетов мнения о пробиотиков " Европейское ведомство по безопасности пищевых продуктов, EFSA Journal 2013; 11 (2) :. 3085 Источник. 2012-11-08</ref>

Для исследования потенциальных эффектов пробиотиков вида Lactobacillus на [[Канцерогенез - образование злокачественных опухолей|рак ]] и антибиотик-ассоциированную диарею, диарею путешественников, детскую диарею и т.д. , применяются методы молекулярной биологии и геномики.<ref>Ljungh, Wadstrom T, изд. (2009). Lactobacillus молекулярной биологии: от геномики к Пробиотики . . Caister Academic Press ISBN 978-1904455417 </ref> Однако научное сообщество предостерегает, что нельзя экстраполировать результаты исследования одного штамма на другие, неизученные.<ref>https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21637035</ref>

В блог посте 2009 г [http://www.sciencebasedmedicine.org/editorial-staff/mark-a-crislip-md-associate-editor/ Mark Crislip] один из экспертов сказал, что пробиотики имеют клинический эффект в лечении диареи, но заявленное широкое применение преувеличено, поскольку организм человека сложная экосистема.<ref>Crislip, Mark (16 January 2009). "Probiotics". Science-based Medicine. Retrieved 8 October 2013.</ref> После этого заявления объем исследований посвященных конкретным штаммам было увеличено был увеличен (см. таблицу ниже).

УтвержденияУтверждение, что некоторые молочнокислые бактерии могут способствовать способствуют увеличению веса у некоторых людей<ref>Million M, Raoult D (February 2013). "Species and strain specificity of Lactobacillus probiotics effect on weight regulation". Microbial Pathogenesis 55: 52–4. doi:10.1016/j.micpath.2012.09.013. PMID 23332210.</ref><ref>Million M, Angelakis E, Paul M, Armougom F, Leibovici L, Raoult D (August 2012). "Comparative meta-analysis of the effect of Lactobacillus species on weight gain in humans and animals". Microbial Pathogenesis 53 (2): 100–8. doi:10.1016/j.micpath.2012.05.007. PMID 22634320.</ref>, остаются спорнымиостается спорным.<ref>Lahtinen SJ, Davis E, Ouwehand AC (September 2012). "Lactobacillus species causing obesity in humans: where is the evidence?". Beneficial Microbes 3 (3): 171–4. doi:10.3920/BM2012.0041. PMID 22968407.</ref>

В [[Профессиональный спорт: история и современное состояние|профессиональном спорте]] часто встречаются жалобы на желудочно-кишечный тракт среди [[ВыносливостьАтлеты Древнего мира|выносливыхатлетов]] спортсменов, таких как бегуны [[бег]]уны или троеборцы<ref>Rehrer NJ, Brouns F, Beckers EJ, Frey WO, Villiger B, Riddoch CJ, Menheere PP, Saris WH: Physiological changes and gastro-intestinal symptoms as a result of ultra-endurance running. Eur J Appl Physiol Occup Physiol 1992, 64:1-8.</ref>. Особенно полезны эубиотики и пробиотики в [[бодибилдинг]]е, так как функция пищеварения напрямую отвечает за усвоение питательных веществ. Эти проблемы связаны с током крови, которая что направляется из внутренних органов к [[Костно-мышечная система|скелетной мускулатуре]] или сердцу<ref>Qarnar MI, Read AE: Effects of exercise on mesenteric blood flow in man. Gut 1987, 28:583-587.</ref>. Такие связанные с тренировками изменения кровотока в кишечнике, равно как и тепловой вред (также вызванный нагрузками) слизистой оболочке оболочки кишечника , могут вызвать нарушения кишечного барьера, что ведет к воспалительному процессу<ref>Lambert GP: Stress-induced gastrointestinal barrier dysfunction and ist inflammatory effects. J Anim Sci 2009, 87(E.Suppl):E101-E108.</ref>. К симптомам относятся [[Проблемы пищеварительной системы|тошнота, желудочные и кишечные спазмы]], [[рвота]] и [[Лечение поноса|диарея]]. Повышение проходимости стенки кишечника приводит к наличию в крови эндотоксинов, что в свою очередь ведет к повышенной подверженности к инфекционным и [[Лечение аутоиммунных заболеваний|аутоиммунным заболеваниям]], из-за поглощения патогенных микроорганизмов/или токсинов тканью и кровотоком<ref>West NP, Pyne DB, Peake JM, Cripps AW: Probiotics, immunity and exercise: a review. Exerc Immunol Rev 2009, 15:107-126.</ref> <ref>Fasano A: Leaky gut and autoimmune diseases. Clinic Rev Allerg Immunol 2012, 42:71-78.</ref><ref>DeOliveira EP, Burini RC: Food-dependent, exercise-induced gastrointestinal distress. J Int Soc Sports Nutr 2011, 8:12.</ref>. Таким образом, пробиотики в качестве добавки представляются весьма полезными для спортсменов.